Сюжет фильма основан на реальных событиях. В основу легла повстанческая операция «Антропоид». Двум агентам сопротивления отдаётся приказ убить генерала СС Рейнхарда Гейдриха, третье лицо в иерархии Третьего Рейха. Его устранение внесло бы колоссальный вклад в победу над нацистским режимом. Немногочисленное пражское сопротивление оказывает Йозефу Габчику и Яну Кубишу всевозможную поддержку.

Военная драма Антропоид стала уже третьим фильмом на тему одноимённой операции. Ранее были выпущены в прокат кинофильмы Покушение и Операция «Восход». Режиссёр фильма Шон Эллис начал работу над проектом за 15 лет до её выхода, когда посмотрел документальную ленту об операции «Антропоид». Для максимальной достоверности сценария создатели кинокартины постоянно сверялись с архивными материалами по операции. Все декорации для съёмок также создавались в соответствии с этими данными. Для их построения потребовалось привлечь 40 человек. Съёмки сцен пыток проводились в том же подвальном помещении, где в действительности проводились пытки.

Чехословацких агентов в фильме исполняют ирландские актёры Джейми Дорнан и Киллиан Мёрфи. На роль пани Моравец изначально была утверждена Эмили Уотсон, но актриса была вынуждена покинуть фильм, и её место заняла Алёна Михулова.