В поисках города Древних земляне натыкаются на секретный форпост, ошибочно принимая его за Атлантиду. При детальном изучении они понимают свою ошибку и всё же находят в этом месте координаты расположения затерянного города. Д-р Элизабет Вейр собирает экспедицию для путешествия через звездные врата, ведь Атлантида находится в... другой галактике. И если на месте исследователи не смогут найти рабочий МНТ, их затея окажется путешествием в один конец.

Этот научно-фантастический сериал стал своего рода спин-оффом Звездных врат: SG-1. Его события начинаются сразу после финала седьмого сезона оригинального проекта. В число основных персонажей вошли несколько второстепенных героев из первоисточника, хотя продюсерам нового проекта пришлось поспорить с остальными создателями Звездных врат. Но их усилия не пропали даром: история полюбилась зрителям и выходила на экраны в течение пяти сезонов.

В ходе кастинга артистов создатели шоу вносили в сценарий правки. Например, персонаж Дэвида Найкла был проходным, но актер так понравился продюсерам, что его, слегка подправленный, герой остался на все сезоны. Съемки сериала проходили в Ванкувере (Канада). Врата для межпланетных путешествий были отлиты из резины специально для проекта Звездные врата: Атлантида.