По пути в родной порт американская подлодка подбирает выживших британского плавучего госпиталя, потерпевшего крушение. А одним из пассажиров, к ужасу всей команды, оказывается женщина. Как считают моряки, это плохая примета, и вскоре на судне действительно начинают происходить странные события: то музыка сама собой заиграет, то герои улавливают какие-то шорохи. Но связано ли это с девушкой? Может, у всего происходящего совсем иные причины?

Должность режиссёра сперва должен был занять Даррен Аронофски — он готовил проект ещё с конца 90-х. Однако позже Аронофски покинул режиссёрский пост ради драмы Реквием по мечте. В картине Глубина Даррен остался как соавтор сценария и продюсер. Съёмочный процесс киноленты, рабочим названием которой было Протей, разворачивался, в основном, на озере Мичиган в Америке, но также и в британских студийных павильонах.

Для съёмок детективного триллера авторы взяли настоящую подводную лодку времён Второй мировой войны, которая в обычное время является экспонатом музея. Подлодку перекрасили, чтобы придать ей реалистичности, хотя позже вернули её в первоначальное состояние. Все актёры незадолго до того, как приступить к работе над фильмом, проходили специальные курсы для подводников, обучались управлять и правильно вести себя на борту подводной лодки.