Скуби-Ду вместе с друзьями отправляется в путешествие автостопом. Неожиданно посреди каменистой пустыни, через которую следует их машина, зависает неопознанный летающий аппарат. Засмотревшись на инопланетную тарелку, компания теряет управление автомобилем и влетает в огромный колючий кактус.

Друзьям несказанно повезло, поскольку авария произошла поблизости станции, которая отслеживает космические сигналы. Стоит признать, что как раз эта местность имеет дурную славу. Говорят, что сюда частенько высаживаются инопланетные десанты с целью похищения местного населения. Скуби-Ду и его компания принимают решение не поддаваться панике, а провести серьезное расследование загадочных происшествий.

Анимационный приключенческий ироничный детективный семейный фильм с элементами фэнтези Скуби-Ду! и нашествие инопланетян — очередная режиссерская работа в полном метре голливудского мультипликатора, драматурга и постановщика Джима Стенструма.

Продюсеры предложили посвятить фильм американской актрисе и мастеру озвучивания еврейского происхождения Мэри Кэй Бергман, которая накануне выхода картины в прокат покончила жизнь самоубийством. Ее голосом говорит персонаж Дафна.

Премьерный показ состоялся в США 5 октября 1999 года. По итогам проката лента удостоилась двух номинаций на международные кинопремии.