У Шэгги Роджерса нет друзей, но однажды среди ночи к нему в дом попадает развеселый немецкий дог Скуби-Ду, который полностью меняет его жизнь. Скуби и Шэгги становятся лучшими друзьями, позже вместе с еще несколькими ребятами они организовывают корпорацию Тайна. Вскоре компанию подростков наказывают за драку в школьном автобусе, которую они якобы организовали. Ребята решают разобраться в происходящем, потому что знают, что все это сделали не они.

Дело в том, что колледж давно уже присмотрели себе призраки, которые делают в нем все, что хотят. Корпорация Тайна начинает собственное расследование. Пока юные детективы разбираются в загадках, они становятся неразлучными друзьями, которые всегда будут друг за друга горой. Узнав, как работать с призраками, они в дальнейшем собираются заниматься паранормальными исследованиями.

Все персонажи мультфильма очень выразительные, у каждого своя история. Велма Динкли — мозговой центр команды, она обо всем догадывается первой. Дафна Блейк — девушка-мажор, влюбленная во футболиста Фреда.

А парень, не зная, что он ей нравится, пытается разными способами привлечь ее внимание. Знакомый зрителям Шэгги — неунывающий, доброжелательный и верный друг. И Скуби — пес с бездонным желудком, которого любят все.