Kolejna część filmu Więzień labiryntu. Bohaterowie, którzy pomyślnie przeszli przez tajemniczy labirynt i przeżyli pierwszą część, czują się względnie bezpieczni. Szybko orientują się, że organizacja Vice przygotowała dla nich nowy test, a labirynt w porównaniu z nim można nazwać treningiem. Tym razem Streferzy trafili na rozciągającą się w nieskończoność pustynię zwaną Kociołkiem. Nie są tam sami. Polują na nich ludzie, zarażeni tajemniczym wirusem. Aby przetrwać Thomas, Minho, Teresa i reszta będą musieli połączyć wszystkie swoje siły.