W błękitnym oceanie u wybrzeży Wielkiej Rafy Koralowej mieszka rybka błazenek Marlin, która ma dorastającego syna Nemo. Chłopiec jest bardzo dociekliwy i nie zdaje sobie sprawy, jak wiele niebezpieczeństw kryje morze. I choć Marlin bardzo starał się pilnować synka, ten pewnego dnia został zabrany przez człowieka. Ojciec znalazł maskę z adresem, dokąd popłynęła łódź ludzi. Razem z poznaną rybką Dory, która cierpi na zaniki pamięci, ruszają na poszukiwania Nemo.