Засекреченная организация по противодействию преступности любого типа под названием ЩИТ, мужчина, жаждущий мести, привлекательная шпионка, отважные Мстители и неизбежная угроза всему мировому пространству — идеальный комплект для фанатов комической Вселенной Мэрвелл. Именно в такую обстановку окунаются зрители анимационного мультфильма Секретные материалы Мстителей: Черная Вдова и Каратель.

Злобный персонаж Каратель осмеливается вмешаться в миссию, выполняемую ЩИТом. Агент Ник Фьери отдает приказ Черной Вдове обезвредить нежелательного противника и не упускать его из поля зрения. Фьери понимает, что Каратель имеет большие возможности по оказанию большой поддержки ЩИТу. Секретные технологии ЩИТа выкрадены террористической группировкой Левиафан, что представляет смертельную угрозу всему живому.

Террористы из Левиафана не теряются и спешат реализовать на черном рынке добытую секретную информацию. Они даже не задумываются над тем, в чьи руки попадут файлы. Для террористов важна сумма, которую предложит потенциальный покупатель. Секретными файлами интересуется большое количество недоброжелателей, что ставит под угрозу спокойную жизнь цивилизации. Удастся ли таким разным персонажам, как Черная Вдова и Каратель, сработаться и остановить коварные планы Левиафана?