Захоплений радянськими військовими під керівництвом фанатичної вченої Ірини Спалько, Індіана Джонс допоміг їм знайти артефакт із потужним магнітним полем, захований на військовому складі. Археолог ховається від росіян, але тепер ФБР підозрює його в шпигунстві. Інді сідає в поїзд, щоби поїхати від усіх проблем. Дорогою його наздоганяє Пес Вільямс і розповідає про зникнення Окслі, старого друга Джонса. Перед зникненням Окслі знайшов кришталевий череп, артефакт, пов’язаний із містом Акатором. Черепом також цікавиться Ірина Спалько.

Четвертий і останній фільм із циклу про пригоди знаменитого археолога Індіани Джонса, поставлений режисером Стівеном Спілбергом, став найбільшим за розміром бюджетом, як порівняти з попередніми трьома частинами. Фінансові вкладення в його створення становили 185,0 млн дол. Пригодницька картина Індіана Джонс і Королівство кришталевого черепа в прокат вийшла тільки у 2008 році, тобто через 19 років після виходу третьої частини фільму.

Стівен Спілберг здебільшого не використовував комп’ютерні можливості для постановки трюків і спецефектів. Сам фільм знімали на плівкову камеру замість цифрової. Шону Коннері, який зіграв роль батька Індіани Джонса в попередній частині, пропонували знову виконати цю роль, але актор відмовився.