У мультфільмі Єгиптус розповідається історія містичної цивілізації, що загубилася у часі та просторі, яка нарешті повертається на Землю. Єгиптус - дивовижні істоти, що володіють магічною «суперсилою», які перебувають у постійній боротьбі за панування над Королівством. Між собою воюють двоє братів - сміливий Кефер, з боку добра, і жорстокий Ексатон, з боку зла, які керують своїми арміями і готують їх до останньої битви. Хлопчик Лео, представник людського роду, став мимовільним учасником цієї війни, успадкувавши безмежну силу Останнього Фараона. Про свою силу Лео дізнається не відразу, але коли дізнається - його життя дуже сильно змінюється. Опинившись між двох світів (добра і зла), Лео вчиться справлятися по-новому з критичними ситуаціями не тільки у світі магії, але і в звичайному житті.