Сказка начинается с рассказа Охотника о том, как он потерял свою калошу. Несмотря на то, что у Охотника есть оружие, этот герой абсолютно безопасен и доброжелателен. Он с радостью знакомит зрителей со своим псом по кличке Бегемот и строит предположения, куда же могла подеваться его любимая калоша. Оказывается, такая неприметная вещь может сыграть важную роль в жизни целого семейства зайчат.

Как известно, зайцы считаются самыми пугливыми лесными животными. Они дрожат от каждого шороха и являются полной противоположностью таких качеств как стрессоустойчивость и спокойствие. Тем не менее находится магический предмет, благодаря которому даже самые трусливые зайчики становятся смельчаками. Кто бы мог подумать, что обычная потерянная калоша приведет к настоящему перевороту в лесной жизни.

Мультфильм Волшебная калоша — уникальная театральная постановка, где каждый актер является куклой, которой управляет кукловод. Режиссер Леонид Кощеников создал необычный микс, состоящий из анимации и сценической игры. Эта была первая серьезная работа режиссера и она осталась в своем роде неповторимой, поскольку позже он начал трудиться над объемной мультипликацией. Сюжет основан на одноименной пьесе Германа Матвеева.